Англійська лексика: Генетика та біотехнологія · Біоінформатика

Що означає FASTQ?

Значення й приклади · Генетика та біотехнологія

скороченняТермін вищого рівня

FASTQ: FASTQ, формат FASTQ

Стандартний текстовий формат сирих даних секвенування. Кожне прочитання займає чотири рядки: назва, послідовність основ, рядок-роздільник і оцінки якості для кожної основи.

Де і як уживається

Використовується для передавання й оброблення даних секвенування. Центри надають стиснені файли .fastq.gz, часто по два на зразок для парнокінцевих прочитань. Якість оцінюють за шкалою Phred: Q30 означає ймовірність помилки основи 1 із 1000. Вимовляють fast-Q.

Приклади речень

  1. The facility sent us two FASTQ files per sample.

    Центр надіслав нам по два файли FASTQ на зразок.

    Файли містять сирі прочитання та їхню якість.

  2. Run quality control on the FASTQ files before alignment.

    Виконайте контроль якості файлів FASTQ перед вирівнюванням.

    Перевірка сирих даних передує зіставленню з референсом.

Поширені словосполучення

  • FASTQ file
  • raw FASTQ files
  • paired FASTQ files
  • FASTQ quality control
  • Phred quality score