Что значит FASTQ?

Где и как употребляется

Формат используют при передаче и обработке данных секвенирования. Центры секвенирования присылают сжатые FASTQ-файлы (.fastq.gz), часто по два файла на образец для парноконцевого чтения. Оценки качества используют шкалу Phred: Q30 означает вероятность ошибки основания 1 к 1000. Название произносят «фаст-кью».

Примеры предложений

1. The facility sent us two FASTQ files per sample.

   Центр секвенирования прислал нам по два FASTQ-файла на образец.

   Для каждого образца получены два файла парноконцевого секвенирования.

2. Run quality control on the FASTQ files before alignment.

   Проведите контроль качества FASTQ-файлов перед выравниванием.

   Качество исходных прочтений проверяют до их сопоставления с референсом.

Распространённые словосочетания

• FASTQ file
• raw FASTQ files
• paired FASTQ files
• FASTQ quality control
• Phred quality score