Что значит BLAST?

Где и как употребляется

BLAST запускают на сайте NCBI или локально; слово используют и как глагол: I BLASTed the sequence («я проверил последовательность с помощью BLAST»). Распространённые варианты — BLASTn для нуклеотидов и BLASTp для белков. В результатах указываются hits (совпадения), процент идентичности и E-value; чем ниже E-value, тем статистически значимее совпадение.

Примеры предложений

1. I BLASTed the unknown sequence, and the top hit was a Pseudomonas species.

   Я проверил неизвестную последовательность с помощью BLAST; лучшим совпадением оказался представитель рода Pseudomonas.

   BLAST сопоставил последовательность с базой и выдал наиболее сходный результат.

2. Check your primers with BLAST to make sure they don't bind to other genes.

   Проверьте праймеры с помощью BLAST, чтобы убедиться, что они не связываются с другими генами.

   Поиск сходных последовательностей помогает выявить возможное неспецифическое связывание праймеров.

Распространённые словосочетания

• run a BLAST search
• BLAST hit
• BLAST against a database
• top hit
• E-value