Что значит alignment?

Где и как употребляется

Термин постоянно используют в биоинформатике. Выравнивание прочтений, также называемое картированием, — первый этап большинства NGS-конвейеров; применяют, например, BWA или Bowtie, а результат сохраняют в BAM-файле. Множественное выравнивание последовательностей сопоставляет много последовательностей, например для построения филогенетического дерева.

Примеры предложений

1. The alignment step took six hours for each genome.

   Этап выравнивания занял по шесть часов для каждого генома.

   Указано время, требуемое для сопоставления прочтений одного образца с референсом.

2. A multiple sequence alignment showed that this region is conserved from fish to humans.

   Множественное выравнивание последовательностей показало, что этот участок консервативен от рыб до человека.

   Сходство последовательностей у разных видов указывает на сохранность участка в ходе эволюции.

Распространённые словосочетания

• read alignment
• sequence alignment
• multiple sequence alignment
• alignment file (BAM)
• alignment rate