Що означає alignment?

Де і як уживається

Щоденний термін біоінформатики. Вирівнювання прочитань, також mapping, є початковим етапом більшості конвеєрів NGS; використовують, наприклад, BWA або Bowtie, а результат зберігають у BAM-файлі. Множинне вирівнювання порівнює багато послідовностей, зокрема для побудови філогенетичного дерева.

Приклади речень

1. The alignment step took six hours for each genome.

   Етап вирівнювання тривав шість годин для кожного геному.

   Вирівнювання є окремим обчислювальним етапом аналізу.

2. A multiple sequence alignment showed that this region is conserved from fish to humans.

   Множинне вирівнювання послідовностей показало, що ця ділянка консервативна від риб до людини.

   Порівняння між видами виявляє еволюційно збережені ділянки.

Поширені словосполучення

• read alignment
• sequence alignment
• multiple sequence alignment
• alignment file (BAM)
• alignment rate