Англійська лексика: Генетика та біотехнологія · Секвенування та геноміка

Що означає read?

Значення й приклади · Генетика та біотехнологія

/riːd/іменникПоширений термін

read: прочитання, рід

У секвенуванні — одна послідовність ДНК, яку прилад зчитує з окремого фрагмента. Один запуск секвенування дає мільйони прочитань.

Де і як уживається

Постійно вживається в секвенуванні та біоінформатиці. Прочитання бувають короткими чи довгими, однокінцевими або парнокінцевими; їх вирівнюють (aligned, mapped) на референсний геном, фільтрують і підраховують. Обговорюють read length — довжину прочитання, read quality — якість і кількість прочитань на зразок.

Приклади речень

  1. We got about 40 million paired-end reads per sample.

    Ми отримали близько 40 мільйонів парнокінцевих прочитань на зразок.

    Зазначено тип даних і їхню кількість для кожного зразка.

  2. Only 70% of the reads mapped to the reference, which suggests contamination.

    Лише 70% прочитань картувалися на референс, що вказує на можливе забруднення.

    Низька частка картованих прочитань може свідчити про сторонній матеріал.

Поширені словосполучення

  • short reads
  • paired-end reads
  • read length
  • map reads
  • read quality