ما معنى BLAST؟

طريقة الاستخدام

يمكن تشغيله على موقع NCBI أو محليًا، ويُستخدم اسمه فعلًا أيضًا: BLASTed the sequence. من إصداراته الشائعة BLASTn للنيوكليوتيدات وBLASTp للبروتينات. تعرض النتائج التطابقات مع نسبة الهوية وقيمة E؛ وكلما انخفضت قيمة E زادت دلالة المطابقة.

أمثلة

1. I BLASTed the unknown sequence, and the top hit was a Pseudomonas species.

   بحثت بأداة BLAST عن التسلسل المجهول، وكانت أفضل مطابقة نوعًا من Pseudomonas.

   تذكر الجملة أن أعلى نتيجة تشابه عرّفت التسلسل ضمن جنس بكتيري.

2. Check your primers with BLAST to make sure they don't bind to other genes.

   افحص البوادئ باستخدام BLAST للتأكد من أنها لا ترتبط بجينات أخرى.

   تطلب الجملة استبعاد ارتباط البوادئ بتسلسلات غير مستهدفة.

تراكيب شائعة

• run a BLAST search
• BLAST hit
• BLAST against a database
• top hit
• E-value

مصطلحات ذات صلة

• alignmentمحاذاة التسلسلات
• bioinformaticsالمعلوماتية الحيوية
• accession numberرقم الإيداع
• primerبادئة

مصطلحات أخرى: المعلوماتية الحيوية

• variant calling · استدعاء المتغيرات الجينية
• pipeline · مسار معالجة آلي
• annotation · إضافة التعليقات التوضيحية الحيوية
• FASTQ · تنسيق FASTQ
• phylogenetic tree · شجرة تطورية