ما معنى FASTQ؟

طريقة الاستخدام

يُستخدم كلما جرى تبادل بيانات التسلسل أو معالجتها. تسلّم مرافق التسلسل ملفات FASTQ مضغوطة (.fastq.gz)، وغالبًا ملفين لكل عينة عند استخدام القراءات من الطرفين. تعتمد درجات الجودة مقياس Phred؛ وتعني Q30 احتمال خطأ قدره 1 من 1000 في القاعدة. وينطق الاسم «فاست-كيو».

أمثلة

1. The facility sent us two FASTQ files per sample.

   أرسل إلينا مرفق التسلسل ملفي FASTQ لكل عينة.

   توضح الجملة عدد ملفات القراءات الخام التي تسلّمها المنشأة لكل عينة.

2. Run quality control on the FASTQ files before alignment.

   أجرِ ضبط الجودة على ملفات FASTQ قبل محاذاة القراءات.

   ترتب الجملة فحص الجودة قبل خطوة محاذاة التسلسلات.

تراكيب شائعة

• FASTQ file
• raw FASTQ files
• paired FASTQ files
• FASTQ quality control
• Phred quality score

مصطلحات ذات صلة

• readقراءة تسلسلية
• pipelineمسار معالجة آلي
• alignmentمحاذاة التسلسلات
• next-generation sequencingتسلسل الجيل التالي (NGS)

مصطلحات أخرى: المعلوماتية الحيوية

• bioinformatics · المعلوماتية الحيوية
• variant calling · استدعاء المتغيرات الجينية
• annotation · إضافة التعليقات التوضيحية الحيوية
• BLAST · أداة BLAST للبحث عن التشابه المحلي
• accession number · رقم الإيداع
• phylogenetic tree · شجرة تطورية