¿Qué significa FASTQ?
Significado en Genética y biotecnología, traducción al español y ejemplos
FASTQ: FASTQ, formato FASTQ
Formato de texto estándar para datos de secuenciación sin procesar. Cada lectura ocupa cuatro líneas: identificador, secuencia de bases, separador y puntuación de calidad de cada base.
Cómo se usa
Se usa al compartir o procesar datos de secuenciación. Los centros suelen entregar archivos comprimidos .fastq.gz; en secuenciación de extremos pareados (paired-end) se reciben normalmente dos por muestra. Las puntuaciones siguen la escala Phred: Q30 equivale a una probabilidad de error de 1 entre 1000 por base. En inglés se pronuncia «fast-Q».
Frases de ejemplo
The facility sent us two FASTQ files per sample.
El centro nos envió dos archivos FASTQ por muestra.
Dos archivos por muestra corresponden habitualmente a las dos lecturas de una secuenciación paired-end.
Run quality control on the FASTQ files before alignment.
Haz el control de calidad de los archivos FASTQ antes del alineamiento.
La instrucción sitúa la revisión de lecturas crudas antes de mapearlas al genoma de referencia.
Combinaciones frecuentes
- FASTQ file
- raw FASTQ files
- paired FASTQ files
- FASTQ quality control
- Phred quality score
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